借上社宅の退去時に支払う違約金の額は妥当なものでしょうか？

まず違約金というのは、短期解約違約金として、契約上賃料２か月という規定があるということでしょうか。その場合は、本件で言うと、賃料４２,０００円ですから、たとえば、入居して１年以内の退去の場合には貸主に対しては８４,０００円の違約金を支払う必要がございます。これは賃貸借契約書に明記しているはずですのでご確認ください。

また、違約金は借主である会社が貸主に支払いますが、このような金額を社員負担にしている会社はあります。これは社宅規定をご確認ください。

敷金ですが、契約時に会社が支払っていれば、通常は会社に戻ってきます。短期での解約であればほとんど物件の原状回復は必要ないでしょうから、敷金の全額近い金額が会社に戻ってくるのではないでしょうか。そうであるならば通常は敷金を入居者が会社に返金をする必要はありませんが、もし会社が払っている敷金が、ご相談者様の口座に返金になるのであれば、それは会社に返す必要がございます。

借上げ社宅については、各社それぞれで社内規定が異なりますので、必ずご確認のうえ、納得して退職なさってください。