土地建物価格按分と消費税

Q.ご相談内容

建築条件付き土地を購入予定の者です。まだ契約していません。
最初に土地の契約をするのですが、ネットに掲載されてる土地価格と、事前に頂いた売買契約書に書かれている土地の金額がちがいます。

下記、具体例です。
　ネット掲載　 土地２０００万 建物１５００万（２７坪） 一坪⇒約５６万 建物内税約１１１万　売買書掲載 土地２５００万
　※この時点ではまだ建物プラン・見積確定が出来ていないので、建物の値段は出ていない。

ネット掲載の間取りではない、別の間取りで、建てて貰う予定ですが、当方としては、合計３５００万（建物の消費税込み 諸費用は別途かかって構わない）以上は出せなません。
金額が違う旨を、不動産に問い合わせたところ、説明があまりよくわかりませんでした。
なんとなく、「買主側の税金対策のため」と解釈できました。

全く同じ土地、同じ建物だとしても、書類上は土地２５００万にすれば、消費税が節税になるというようなニュアンスでした。
　ネット掲載　 土地２０００万 建物１５００万（２７坪） 一坪数学約５６万 内税約１１１万
　売買書掲載　 土地２５００万 建物１０００万（２７坪） 一坪数学約３７万 内税約 ７４万　内税約２５万の節税だと…。

当方としては、税込みで３５００万なので、そんなややこしいことしなくてもいいのでは？と思っています。
結局同じ３５００万を支払うなら、ややこしいことしないで、土地は土地の価格・建物は建物の価格として表示して、それで契約するほうが分かりやすいし、いいように思うのですが、このような手法は、違法でもなく、多くの不動産業者がなさっていることでしょうか。また、当方のデメリットやリスクはないのでしょうか。
※同じ契約書に、「違約金」「反社会勢力」の場合、土地価格の20％が課されるとあります。
土地価格を高くしておけば、これらの金額があがるので、それをメリットに考えて、不動産業者は提示しているのでしょうか。